Уродженець Сан-Паулу, міста на південному сході Бразилії, столиці однойменного штату. Займався футболом у «Корінтіансі», в 11-річному віці переїхав до академії португальської «Браги». З 2019 року – гравець «Фамалікана». Починаючи з сезону 2020/21 років тренувався з основною командою. 5 грудня 2020 року дебютував на професіональному рівні за «Фамалікан» у нічийному (2:2) домашньому матчі 9-го туру Прімейра Ліги проти «Спортінга». Жоау вийшов на поле на 60-й хвилині замість Рубена Ламейраша[1]. У віці 17 років і 6 місяців став наймолодшим гравцем, який дебютував на професіональному рівні з «Фамалікан»[2]. Прот основним гравцем португальського клубу не став, за два сезони зіграв 8 матчів у вищому дивізіоні португальського чемпіонату.
1 вересня 2021 року перейшов в оренду до «Бенфіки Б»[3]. У футболці резервної команди «Бенфіки» дебютував 11 вересня 2021 року в нічийному (0:0) домашньому поєдинку 5-го туру Сегунда-Ліги проти «Спортінга» (Ковілья). Жоау Нету вийшов на поле на 63-й хвилині замість Мартіма Нету[4]. Загалом у складі «Бенфіки Б» провів 12 матчів. Наприкінці червня 2023 року повернувся в «Фамалікан», але з того часу в першій команді не грав (двічі потрапляв до заявки на матчі вищого дивізіону португальського чемпіонату), натомість захищав кольори команди U-23.
