Sorgenfrei har publicerat en rad böcker, bland annat en introduktion till islam på svenska[3] tillsammans med religionshistorikern Susanne Olsson vid Stockholms universitet samt två omfattande monografier om islam och muslimer i Sverige.[4] Forskningsmässigt har Sorgenfrei även ägnat sig åt antireligiösa hatbrott[5] liksom åt forskning om radikalisering och våldsorienterad islam. Han har även skrivit om esoteriska strömningar och mystik,[6] om konst och religion,[7] poesi,[8] samt om medeltida sufilyrik och översatt Jalal al-din Rumi och Shaikh Sa'di till svenska från persiska.[9]
Näktergalen. Erik Johan Stagnelius. Malmö, Ellerströms, 2023. ISBN 9789172477087. 126 sidor.
"De kommer att vara annorlunda svenskar". Berättelsen om Sveriges första muslimer. Stockholm, Norstedts. ISBN 9789113118871. 347 sidor.
Kvinnligt religiöst ledarskap. En vänbok till Gunilla Gunner. Red. tillsammans med David Thurfjell. Stockholm: Södertörns högskola. ISBN 9789189109032. 366 sidor.
Religion, migration och polisiärt arbete. Red. tillsammans med Göran Larsson och Tanja Viklund. Stockholm: Studentlitteratur 2020. ISBN 9789144141695. 317 sidor.
Religion. Tillsammans med Göran Larsson. Stockholm: Liber 2019. ISBN 9789147096718. 110 sidor.
Islam i Sverige. De första 1300 åren. Stockholm, SST 2018. ISBN 9789198345322. 347 sidor.
Det monoteistiska landskapet. Ivan Aguéli och Emanuel Swedenborg. Lund: Ellerströms 2018. ISBN 9789172475328. 111 sidor.
Religiösa minoriteter från Mellanöstern. Tillsammans med Göran Larsson och Max Stockman. Stockholm, SST 2017. 184 sidor.
Sufism i Sverige - en lägesrapport från Stockholm, Göteborg och Malmö. Stockholm, SST 2016. ISBN 978-91-983453-0-8. 104 sidor.
Islam - en religionsvetenskaplig introduktion. Stockholm, Liber 2015 (Red.) tillsammans med Susanne Olsson. ISBN 9789147112043. 351 sidor.
American Dervish: Making Mevlevism in the United States of America. Göteborgs universitet 2013. ISBN 9789162887223. 385 sidor.
Mystik och andlighet. Kritiska perspektiv. Dialogos förlag, Stockholm 2013, (Red.). ISBN 9789175042596. 255 sidor.
Perspektiv på islam. En vänbok till Christer Hedin. Dialogos förlag, Stockholm 2011, (Red.) tillsammans med Susanne Olsson. ISBN 9175042436. 250 sidor.
Den religiösa artefakten. Symboler i sex religioner. Fondi förlag, Stockholm 2010. ISBN 9789163362200. 59 sidor.
Kärleken begär att detta tal skall fram - Jalal ud-din Rumis liv, lära och lyrik. Eget förlag (Molin & Sorgenfrei), Stockholm 2008, tillsammans med Ashk Dahlén. ISBN 9789197751308. 172 sidor.