Onondaga County är ett administrativt område i delstaten New York, USA. År 2010 hade countyt 467 026 invånare. Den administrativa huvudorten (county seat) är Syracuse.
Countyt ligger i Finger Lakesområdet.
Enligt United States Census Bureau så har countyt en total area på 2 087 km². 2 021 km² av den arean är land och 66 km² är vatten.