Nagano prefektur är en prefektur i Chūbu-regionen på ön Honshu, Japan. Residensstaden är Nagano. Det är en av de få prefekturer i Japan som saknar kust.
Prefekturen var år 2016 indelad i nitton städer (-shi) och 58 kommuner (-chō, -machi och -mura).[1]
Kommunerna grupperas i fjorton distrikt (-gun). Distrikten har ingen administrativ funktion utan fungerar i huvudsak som postadressområden[4].