Gezelius svarade för bearbetningen av 1695 års psalmboks finskspråkiga version (Uusi Suomenkielinen Wirsi-Kirja Niiden Cappalden canssa, jotca siihen tulevat), som utgavs 1701. Psalmboken innehöll vid sidan av 413 psalmer också bland annat predikotexter och böner för helgdagarna.[1] Psalmboken, senare kallad Vanha virsikirja ("den gamla psalmboken"), kom att vara i bruk officiellt i nära tvåhundra år, i vissa väckelsekretsar in på 2000-talet.
Johannes Gezelius den yngre var son till Johannes Gezelius d.ä. och Gertrud Gutheim. Han är begravd i Åbo domkyrka, liksom sin far och sin son.
Gezelius d.y. var en av de drivande i de rättsliga processerna mot Georg Lybecker.