Jay County är ett administrativt område i delstaten Indiana, USA. År 2010 hade countyt 21 253 invånare. Den administrativa huvudorten (county seat) är Portland.
Countyt grundades 1836 och fick sitt namn efter John Jay, den första chefsdomaren i USA:s högsta domstol.
Enligt United States Census Bureau har countyt en total area på 994 km². 994 km² av den arean är land och 0 km² är vatten.