Seger blev assistent vid Museum schlesischer Altertümer i Breslau1890 och föreståndare för den historiska samlingarna 1899. Han var direktör för staden Breslaus konstsamling och professor vid Breslaus universitet sedan 1908.
På grund av sin objektivitet och saklighet intog Seger en central ställning inom den arkeologiska forskningen. Tillsammans med Carl Schuchhardt och Karl Schumacher grundade och utgav han 1909Prähistorische Zeitschrift.