Säsongen 2009 bildades ett nytt team i Swedish Touring Car Championship, Team Biogas.se. Ekblom blev, tillsammans med Patrik Olsson, teamets förare. Teamet körde med biogasdrivnaVolkswagen Scirocco-bilar. Säsongen 2010 hade teamet fått mer konkurrenskraftiga bilar och Ekblom slutade tredje plats totalt, efter tre segrar under säsongen. Under säsongen 2011 vann Team Biogas.se teammästerskapet före Polestar Racing, men Ekblom blev tvåa totalt i förarmästerskapet bakom ChevroletförarenRickard Rydell. Ekblom hade dock fortfarande chansen att bli mästare när sista racet startade, men Rydell vann med två poängs marginal. Team Biogas.se lämnade dock in en protest mot Rydell, då de ansåg att han kört om Thed Björk under gulflagg, men efter långa utredningar och protester lades fallet ned den 27 januari 2012, fyra månader efter säsongsavslutningen.[1]