Fadern Bob Mollohan representerade West Virginias första distrikt i representanthuset 1953-1957 och 1969-1983. Han bestämde sig för att inte kandidera till omval i kongressvalet 1982. Han meddelade i stället att han stöder sin son Alan till representanthuset. Alan Mollohan vann knappt och efterträdde sin far som kongressledamot 3 januari 1983.