Czartoryski var polsk tronkandidat 1763 men besegrades av sin kusin Stanisław II August Poniatowski. Efter brytning med denne trädde Czartoryski 1782 i österrikisk tjänst, blev överste för galiziska gardet och 1805 fältmarskalk men behöll sitt säte i polska riksdagen. 1788-1791 motarbetade han det ryska inflytandet och verkade för ett polskt arvrike med saxisk dynasti men blev som oavhängighetspartiets talesman i Dresden 1791 avvisad. Som riksdagsmarskalk av Napoleons nåde bidrog han till bildandet av generalkonfederationen samma år.