В 1796 году Соболевский издал каталог известных ему местных и иностранных растений, в 1799 году — книгу на латинском языке Flora petropolitana («Санкт-Петербургская флора»), в которой описывал флору Петербурга и окрестностей.
Sobolewsky G. Flora petropolitana sistens plantas in gubernio Petropolitano sponte crescentes, tam eas quae olim in Flora Ingrica Krascheninnikowii a Gortero enumeratae sunt, quam novas post annum 1764 hucusque a variis Botanicis Petropoli degentibus detectas, nunc vero generice et specifice descriptas cum additione variam observationum atque Russica plantarum denominatione. — Petropoli, 1799. — VII, 354 с.
[Соболевский, Г.] Санктпетербургская флора или описание находящихся в Санктпетербургской губернии природных растений, с приложением некоторых иностранных, кои на открытом воздухе в здешнем страноположении удобно произрастают, и с показанием оных силы, действия и употребления, в пользу для сельских жителей и любителей травознания. Творение Надворного Советника, Медицины Доктора, Государственной Медицинской Коллегии и Экономического Санктпетербургского Общества почетного Члена, Ботаники и материи Медики Профессора, Григория Соболевскаго. В 2 ч. Ч. 1-2. — СПб: Тип. при Губернском правлении, 1801, 1802. — 410, 424 с.
Роды и некоторые виды растений и грибов, названные в честь Г. Ф. Соболевского