NS5B

Геном ВГС

Неструктурный белок 5B (NS5B) — белок вируса гепатита С (ВГС)[1]. Представляет собой РНК-полимеразу, его ключевая функция репликация вирусной РНК из вирусной РНК положительный нити в качестве шаблона, чтобы катализировать полимеризацию rNTP во время репликации РНК[2][3][4].

Несколько кристаллических структур NS5B полимеразы в нескольких кристаллических форм были определены на основе консенсуса последовательности БК (ВГС-БК Генотип 1)[5].

Структура напоминает правую руку формы с ладонью и пальцами, в окружение активного центра, уникального для NS5B, содержащихся в ладони структуры белка.

Препараты, направленные на NS5B

Несколько препаратов на рынке или на различных этапах исследования целевой NS5B в качестве средства предотвращения дальнейшего вирусной РНК репликации и, следовательно, лечения или лечения ВГС[6]:

• Beclabuvir^[англ.], в настоящее время в клинических испытаниях
• Дасабувир (Viekira Pak), ненуклеозидные ингибиторы/нуклеотидных аналогов, одобрен FDA в декабре 2014 года (только в сочетании с омбитасвиром, паритапревиром и ритонавиром)
• Deleobuvir^[англ.], развитие прекращается
• Filibuvir^[англ.], развитие прекращается
• Radalbuvir^[англ.], в настоящее время в клинических испытаниях
• Setrobuvir^[англ.], развитие прекращается
• Софосбувир нуклеотидный аналог, одобренный FDA в декабре 2013 года (Sovaldi; Harvoni (комбинация с ледипасвир)).

См. также

• NS5A

Примечания

1. Gehring S., Gregory S. H., Wintermeyer P., Aloman C., Wands J. R. Generation of Immune Responses Against HCV Using Dendritic Cells Containing NS5 Protein-Coated Microparticles (англ.) // Clin. Vaccine Immunol.^[англ.] : journal. — 2008. — December (vol. 16, no. 2). — P. 163—171. — doi:10.1128/CVI.00287-08. — PMID 19091993. — PMC 2643538.
2. Z; Jin; Leveque, V; Ma, H; Johnson, K. A.; Klumpp, K. Assembly, purification, and pre-steady-state kinetic analysis of active RNA-dependent RNA polymerase elongation complex (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2012. — Vol. 287, no. 13. — P. 10674—10683. — doi:10.1074/jbc.M111.325530. — PMID 22303022. — PMC 3323022.
3. Moradpour, D; Penin, F; Rice, C. M. Replication of hepatitis C virus (неопр.) // Nature reviews. Microbiology. — 2007. — Т. 5, № 6. — С. 453—463. — doi:10.1038/nrmicro1645. — PMID 17487147.
4. Rigat, K.; Wang, Y.; Hudyma, T. W.; Ding, M.; Zheng, X.; Gentles, R. G.; Beno, B. R.; Gao, M.; Roberts, S. B. Ligand-induced changes in hepatitis C virus NS5B polymerase structure (англ.) // Antiviral Research^[англ.] : journal. — 2010. — Vol. 88, no. 2. — P. 197—206. — doi:10.1016/j.antiviral.2010.08.014. — PMID 20813137.
5. Biswal, B. K.; Cherney, M. M.; Wang, M.; Chan, L.; Yannopoulos, C. G.; Bilimoria, D.; Nicolas, O.; Bedard, J.; James, M. N. Crystal structures of the RNA-dependent RNA polymerase genotype 2a of hepatitis C virus reveal two conformations and suggest mechanisms of inhibition by non-nucleoside inhibitors (англ.) // The Journal of Biological Chemistry : journal. — 2005. — Vol. 280, no. 18. — P. 18202—18210. — doi:10.1074/jbc.M413410200. — PMID 15746101.
6. Biswal, B. K. Non-nucleoside inhibitors binding to hepatitis C virus NS5B polymerase reveal a novel mechanism of inhibition (англ.) // Journal of Molecular Biology^[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 361, no. 1. — P. 33—45. — doi:10.1016/j.jmb.2006.05.074. — PMID 16828488.