После выпуска остался работать в университете сперва препаратором, а с 1910 года — помощником прозектора кафедры нормальной анатомии. С 1915 года — исполняющий обязанности прозектора по той же кафедре, с 1917 года — прозектор. Проводил научно-исследовательскую работу в направлении сосудистой анатомии[9]. Одновременно трудился на Одесских высших женских медицинских курсах: с 1910 года прозектором кафедры нормальной анатомии и с января 1917 года преподавателем химико-фармацевтического отделения физико-математического факультета. Под руководством профессора Н. А. Батуева подготовил и защитил в мае 1917 года докторскую диссертацию на тему «К вопросу о венах основания черепа вместе с некоторыми ближайшими к ним сосудами»[10]. В сентябре 1917 года был избран приват-доцентом Новороссийского университета[3].
В 1920 году эмигрировал в Королевство сербов, хорватов и словенцев (КСХС). В 1920/1921 учебном году преподавал гигиену и физиологию человека в Первой русско-сербской гимназии в Белграде. В 1921—1923 годах был профессором нормальной анатомии медицинского факультета Белградского университета. Состоял членом Общества русских учёных в КСХС[11]. Перевёл на сербский язык, дополнил и издал в 1923 году в Нови-Саде учебник своего учителя Н. А. Батуева «Анатомия человека»[12][13]. В 1923 году переехал в Болгарию. С 1923 по 1933 год возглавлял Анатомический институт Софийского университета[3]. В период с 1926 по 1930 годы издал первый в своём роде учебник «Анатомия человека» (в 3-х частях) на болгарском языке. Одна из частей этого учебника, «Сердце и внутренние органы», переиздавалась в Софии в 1946 и 1948 годах[10]. Этим учебным пособием было положено начало кодификации болгарской анатомической терминологии[14].
В 1932 году избран Русским Академическим союзом в Болгарии в состав учебного комитета при Комитете русских беженцев, который ведал назначением и увольнением персонала школ, утверждением их учебных программ, распределением часов и т. п.[15] С 1934 года работал участковым врачом в с. РаждавицаКюстендилской области и занимался частной практикой в Софии. Член правления Союза русских врачей с 1938 года[3].
Жена (с 1904 года) — Анна Севастьяновна Танатар (1885—?), дочь доктора химии, профессора Новороссийского университета С. М. Танатара, похоронена в Москве[2][5]. Их дети:
Борис Ильич Шапшал, умер от дизентерии в восьмилетнем возрасте в 1917 году[6].
Наталия Ильинична Шапшал (в замужестве Власова), окончила медицинский факультет в Софии, акушер-гинеколог. В 1955 году вместе с матерью, мужем и дочерью переехала из Болгарии в Одессу, а потом в Москву, где заведовала отделением одной из клиник[3][6][11].
↑ 12Прохоров Д. А. Члены семьи И. И. Казаса и близкие родственники // И. И. Казас — просветитель караимов и крымских татар. — Материалы по археологии, истории и этнографии Таврии. — Симферополь, 2009. — Вып. 7. — С. 223. — (Supplementum). — 200 экз. — ISBN 978-966-1538-16-9.
↑Горизонты памяти // Его величество — пациент : ежемесячная газета. — Одесса, 2019. — № 4 (182) (апрель). — С. 7.
↑ 123Незабытые могилы : российское зарубежье : некрологи 1917—1997 : в 6 т. / Российская гос. б-ка. Отд. лит. рус. зарубежья ; сост. В. Н. Чуваков ; под ред. Е. В. Макаревич. — М. : Пашков дом, 2007. — Т. 6, кн. 3: Х—Я. — С. 301. — 703 с. — 1000 экз. — ISBN 5-7510-0354-3 (т. 6).
↑Материалы для библиографии русских научных трудов за рубежом. (1920—1930) / ред. Е. В. Спекторский. — Белград : Издание Русского Научного Института в Белграде, 1931. — Вып. 1. — С. 365.
