Деревня Чижгора расположена в юго-западной части Мезенского района, на левом берегу реки Со́ва, недалеко от её впадения в реку Немнюга. На правом берегу Со́вы находится деревня Совполье. К северу от Чижгоры и Совполья Немнюгу пересекает мост автодороги «Архангельск — Пинега — Кимжа — Мезень».