В 1967—1968 годах работал в Серено-Заводской школе Козельского района учителем русского языка и литературы. В свободное от школы время, продолжив своё детское увлечение краеведением, писал в местные газеты статьи, эссе и заметки о колхозниках и деревенской жизни[3].
В 1974 году Анатолий Черников по предложению ректора КГПИ Михаила Касаткина организовал факультет по работе с иностранными студентами, на котором ежегодно учились в том числе около ста студентов из Германской Демократической Республики. С началом перестройки факультет был закрыт[3].
К этому времени Черников уже был заведующим кафедры литературы КГПИ, на которой провёл организационные реформы, укрепив её новыми преподавателями и существенно повысив её научную продуктивность. Без отрыва от работы на кафедре Анатолий Черников написал и защитил докторскую диссертацию на тему «Проза И. С. Шмелева: Концепция мира и человека», после чего ему было присвоено учёное звание профессора[3][4].
В Калужском государственном педагогическом институте имени К. Э. Циолковского (с 2010 года — Калужский государственный университет имени К. Э. Циолковского) Черников занимал должности ассистента, заместителя декана, старшего преподавателя, декана факультета по работе с иностранными студентами, проректора по заочному обучению, заведующего кафедрой литературы (1982—2006), профессора кафедры литературы (с 2006)[1][5].
В российской научной среде имеет неоднозначную репутацию. Журнал «Новое литературное обозрение» писал в 1998 году в рецензии на книгу Черникова «Серебряный век русской литературы» (1998):
…Достаточно удачно объединив общие места советского литературоведения и «патриотической» публицистики наших дней, автор добился того, что 400-страничная книга не имеет никакой педагогической, а тем более научной ценности[1].
Одна из монографий Черникова, «Песенный мир Б. Окуджавы» (2013), полностью представляет собой плагиат[6].
Черников А. П. Поэт рода царского: судьба и творчество Константина Романова. — Калуга: КГУ им. К. Э. Циолковского, 2011. — 204 с.
Черников А. П. Николай Михайлович Кучеровский. Очерк жизни и творчества / Под редакцией Ю. А. Дробышева. — Калуга: КГПУ, 2009. — 32 с. — (Выдающиеся учёные и педагоги Калужского педуниверситета).
Черников А. П. Песенный мир Б. Окуджавы: Монография. — Калуга: КГУ им. К. Э. Циолковского, 2013. — 212 с. — 100 экз.
Автор главы коллективной монографии
Черников А. П.Шмелёв (1873—1950) // Литература русского зарубежья, 1920—1940. Выпуск 2 / Ответственный редактор О. Н. Михайлов. — М.: ИМЛИ, Наследие, 1999. — С. 51—84. — 328 с.
Редактор, составитель, автор вступительной статьи и комментариев
Островский Н. Как закалялась сталь / Составление, вступительная статья и комментарии А. П. Черникова. — М.: Русский язык, 1984.
Шмелёв И. Светлая страница / Составление, вступительная статья и комментарии А. П. Черникова. — Калуга: Гриф, 1995.
Проза и поэзия серебряного века: Хрестоматия для учащихся / Составление, вступительная статья и комментарии А. П. Черникова. — Калуга: Гриф, 1995.
Зайцев Б. Атлантида / Вступительная статья А. П. Черникова. — Калуга: Гриф, 1996.
Амфитеатров А. Бабы и дамы / Вступительная статья А. П. Черникова. — Калуга: Гриф, 1997.
Оптина пустынь и русская культура: Материалы вторых всероссийских Киреевских чтений / Редактор А. П. Черников. — Калуга: Гриф, 1998. — 79 с.
Статьи
Черников А. П. Ранний Шмелёв // Русская литература XX века. Дооктябрьский период: Сборник третий / Редакторы Н. Кучеровский, А. Карпов, Н. Манаев. — Калуга, 1971.
Черников А. П. «Недальный русский городок»: Калуга и калужане в творчестве И. С. Шмелева // Калуга в шести веках: Материалы 5-й городской краеведческой конференции. — Калуга: Полиграф-Информ, 2005. — С. 243—250.
Черников А. П. Литературно-эстетические воззрения И. В. Киреевского // Литература в школе. — 2006. — № 11. — С. 8—10. — ISSN0130-3414.
Черников А. П. «Печалюсь и люблю»: человек, природа, Родина в поэзии Ст. Куняева // Литература в школе. — 2007. — № 11. — С. 17—20. — ISSN0130-3414.
Черников А. П. След на Земле. Личность и творчество Н. М. Кучеровского // Калуга в шести веках: Материалы 6-й городской краеведческой конференции / Составитель В. А. Дьяченко. — Калуга: Полиграф-Информ, 2008. — С. 107—113.
Черников А. П. Духовно-нравственные искания в автобиографической прозе русского зарубежья (Бунин — Шмелёв — Зайцев) // Литература в школе. — 2008. — № 6. — С. 3—6. — ISSN0130-3414.
Черников А. П., Тимофеева Е. А. «Здесь Вы всколыхнули всех…» (Писатель И. А. Новиков и Калужский край) // Калуга в шести веках: Материалы 7-й городской краеведческой конференции. — 2009. — С. 29—42.
Черников А. П. «Тогда создаётся роман…»: о жанрово-стилевом своеобразии «Дуэли» А. П. Чехова // Литература в школе. — 2010. — № 3. — С. 8—10. — ISSN0130-3414.
Черников А. П. «Напитанный счастьем воздух». Тема первой любви в рассказе И. Шмелёва «Весенний ветер» // Литература в школе. — 2010. — № 6. — С. 21—23. — ISSN0130-3414.
Черников А. П. Величие подвига: проблема нравственного выбора в прозе второй половины XX — начала XXI века о Великой Отечественной войне // Литература в школе. — 2011. — № 4. — С. 2—5. — ISSN0130-3414.
Черников А. П. Жизнь и творчество А. Амфитеатрова в эмиграции // Вопросы истории, культуры, природы Верхнего Поочья. — Калуга, 2012.
Черников А. П. О поэтике Бориса Зайцева // Словесное искусство Серебряного века и русского Зарубежья в контексте эпохи. Ч. II. — М., 2012.
Черников А. П. «Глаза, глядящие на Русь…». О поэзии Марины Цветаевой // Золотая Ока. — Калуга. — № 2.
Черников А. П. Уроки духовности. Повесть В. Распутина «Прощание с Матёрой» на уроках литературы // Литература в школе. — 2012. — № 6. — С. 2—6. — ISSN0130-3414.
Черников А. П. «Понимать, беречь природу». Экологическая проблематика в прозе В. П. Астафьева // Литература в школе. — 2013. — № 4. — С. 15—19. — ISSN0130-3414.
Черников А. П. «Светлое царство русское». Повесть И. С. Шмелёва «Росстани» как художественный комментарий к изучению драмы А. Н. Островского «Гроза» // Литература в школе. — 2013. — № 9. — С. 13—16. — ISSN0130-3414.
Черников А. П. «Великий мастер слова и образа». К 140-летию со дня рождения И. С. Шмелёва // Литература в школе. — 2013. — № 10. — С. 2—8. — ISSN0130-3414.
Черников А. П. «…Нам нужна одна победа»: тема Великой Отечественной войны в поэзии Булата Окуджавы // Литература в школе. — 2014. — № 1. — С. 20—22. — ISSN0130-3414.
Черников А. П. Нравственная сила доброты: повесть Б. Васильева «Не стреляйте в белых лебедей». Материалы для учителя // Литература в школе. — 2014. — № 5. — С. 12—14. — ISSN0130-3414.
Черников А. П. «Вещее слово поэта»: к 125-летию со дня рождения А. Ахматовой // Литература в школе. — 2014. — № 6. — С. 13—18. — ISSN0130-3414.
Черников А. П. «Это муза не прошлого дня»: Художественные искания С. Есенина / Иллюстрации Станислава Епифанова, Н. Ящука // Литература в школе. — 2015. — № 1. — С. 2—8. — ISSN0130-3414.
Черников А. П. «Жажда праведности»: повесть «Богомолье» в контексте духовных и эстетических исканий И. Шмелёва // Литература в школе. — 2016. — № 10. — С. 15—19. — ISSN0130-3414.
Черников А. П. Песнь о России: быт и бытие в романе И. С. Шмелева «Лето Господне» / Иллюстрации Натальи Исаичевой // Литература в школе. — 2017. — № 8. — С. 17—22. — ISSN0130-3414.
Черников А. П. «Город двойного бытия»: традиции Ф. М. Достоевского в урбанистической поэзии А. Блока / Иллюстрации Марины Георгиевны Тиме-Блок // Литература в школе. — 2018. — № 10. — С. 19—21. — ISSN0130-3414.
↑Черников А. П. Проза И. С. Шмелева: Концепция мира и человека: Дис. в виде опубликов. моногр… д-ра филол. наук: Спец. 10.01.01 — русская литература / Калуж. гос. пед. ун-т им. К. Э. Циолковского. — М., 1996. — 343 с.
Чупринин С. И. Черников Анатолий Петрович // Чупринин С. И. Новая Россия: мир литературы: Энциклопедический словарь-справочник: В 2 т.. — М.: Вагриус, 2003. — Т. 2: М—Я. — С. 613. — ISBN 5-9560-0157-7.
Черников Анатолий Петрович // Кто есть кто в российском литературоведении: Биобиблиографический словарь-справочник / РАН, ИНИОН, Центр гуманитарный научно-информационных исследований, Отдел литературоведения; Главный редактор Николюкин А. Н.; Научный редактор Ревякина А. А.; Ответственный секретарь Соколова Е. В.; Составители: Кравченко Т. Н., Михайлова О. В., Петрова Т. Г., Ревякина А. А.. — М.: ИНИОН РАН, 2011. — С. 371—372. — ISBN 978-5-248-00591-8.