26 стран КАФ подали заявки на участие в чемпионате мира по футболу 1990 года. Однако, Сенегал не участвовал, а Маврикий и Мозамбик были отвергнуты ФИФА из за задолженности перед ФИФА. Африканская континентальная зона получила 2 (из 24) путёвки в финальный турнир.
Отборочный турнир был сыгран в три этапа:
Первый этап: 8 стран (Алжир, Камерун, Египет, Кения, Марокко, Кот-д’Ивуар, Нигерия и Заир) выходят сразу во второй этап. Оставшиеся 16 команд были разбиты на пары и в двух матчах (дома и в гостях) определяли участников второго этапа.
Второй этап: 16 команд были разделены на 4 группы по 4 команды в каждой. Команды играли каждая с каждой два матча (дома и в гостях). Победители групп попадали в финальный этап.
Финальный этап: 4 страны были разбиты на пары и в двух матчах (дома и в гостях) определяли обладателей путёвок.