В 1874 был приглашен участвовать в создании Ликской обсерватории, разработал её окончательный проект, был главным консультантом во время строительства, а в 1888, после завершения строительства, стал директором обсерватории и занимал этот пост до 1897 года. Сыграл большую роль в развитии обсерватории и росте её авторитета в научном сообществе[3].
С 1901 года работал библиотекарем в академии Уэст-Пойнт.
Эдвард Синглтон Холден умер 16 марта 1914 года в Уэст-Пойнте.
Основные труды в области наблюдений туманностей, планет и их спутников, звезд. С помощью 36-дюймового Ликского рефрактора получил большое количество превосходных фотографий планет и Луны.
В его честь назван кратер на Луне и кратер на Марсе, а также астероид(872) Хольда, открытый в 1917 году.
Колчинский И. Г., Корсунь А. А., Родригес М. Г. Астрономы: Биографический справочник. — 2-е изд., перераб. и доп. — Киев: Наукова думка, 1986. — 512 с.