В устьевой части реки Наяхан ранее располагался посёлок Наяхан, который с 1931 года являлся центром Северо-Эвенского района Магаданской области.
Примерно в 7,5 км от истока по правому берегу реки Наяхан расположено озеро Нярка, которое питает реку Наяхан.
Для верхнего течения характерны большие наледи, которые не тают в течение всего лета.
В среднем течении пойма не широкая, с многочисленными старыми высохшими руслами, и узкими протоками, образовавшимися в результате эрозийной деятельности стока реки во время весенних паводков.
До настоящего времени река Наяхан является внутренним водным рыбохозяйственным объектом на котором осуществляется рыболовство лососевых видов рыб — горбуши, кеты, гольца.
Примечания
↑Ресурсы поверхностных вод СССР: Гидрологическая изученность. Т. 19. Северо-Восток / под ред. Ю. Н. Комарницкой. — Л.: Гидрометеоиздат, 1966. — 602 с.
↑Магаданская область, Чукотский автономный округ // Общая характеристика территории / сост. и подгот. к изд. ПКО «Картография» и Госцентром «Природа» в 2004 г. ; гл. ред. А. Н. Краюхин ; отв. ред.: Г. В. Поздняк, Н. Н. Полункина, Н. В. Смурова. — М. : Роскартография, 2004. — С. 118. — (Национальный атлас России : в 4 т. ; 2004—2008, т. 1). — ISBN 5-85120-217-3.