Турнир проходил по системе плей-офф до стадии 1/8 финала, победители этой стадии играли с проигравшими в 1/8 финала Лиги чемпионов за место в групповом этапе. В групповом этапе участвовали 8 команд, разбитые на 2 группы по 4 команды. Впервые в истории турнира из группы выходили 2 лучшие команды и были проведены полуфиналы, победители которого разыграли трофей в двухматчевом финале.
Федерации, занимающие в рейтинге КАФ места с 1-го по 12-е, имели возможность выставить по 2 команды. Так как 3 федерации разделили 12-е место в рейтинге для сезона 2009, всем трём было дано право выставить по 2 команды.
Оба клуба из Ганы отказались от участия в турнире[1][2], Марокко, Судан и Южная Африка[3] выставили по 1 клубу. Вне квот принял участие победитель прошедшего розыгрыша «Сфаксьен» из Туниса. Таким образом, в турнире приняли участие 45 команд, представляющих 34 федерации.
Клубы двух федерации (Экваториальной Гвинеи и ЦАР) изъявили желание принять участие в турнире после окончания приёма заявок. Для них был организован промежуточный раунд, победитель которого мог пройти в 1/16 финала в случае снятия или отказа любого клуба на данной стадии, поскольку подобного не случилось, на этом их участие в турнире было окончено.
Жирным выделены 19 команд, начавших участие с 1/16 финала, минуя предварительный раунд.
Курсивом выделены клубы из ЦАР и Экваториальной Гвинеи, участвовавшие в специально организованном промежуточном раунде.
1 Оба участника от Ганы — бронзовый призёр «Арсенал» и занявший четвёртое место «Либерти» отказались от участия в турнире.[1][2]
2 В федерации футбола Южной Африки забыли, что имеют право выставить 2 команды на турнир, поэтому заявка на участие бронзового призёра чемпионата ЮАР «Сантос» не была подана.[3]
.svg){kind=small}
