В 1920—1923 годах Кондо находился в Германии в составе японской делегации, целью которой было удостовериться в том, что Германия соблюдает Версальский договор. По возвращении 1 декабря 1923 года он был повышен до капитана 2-го ранга и направлен на шесть месяцев на линкор Муцу. В 1924—1925 он был адъютантомкронпринцаХирохито. Затем Кондо становится преподавателем в Военной академии Императорского флота и получает звание капитана 1-го ранга. Служит на нескольких должностях в генштабе флота Японии. В 1929—1930 является капитаном крейсера Како[англ.], а в 1929—1930 — линкора Конго.
Кондо был деморализован поражениями гуадалканальской кампании, и вскоре его сняли со всех постов, предполагающих реальную власть. Его отправили на острова Трук[3].
Кондо назначили заместителем командира Объединённого флота в октябре 1942, а 29 апреля 1943 — дали звание полного адмирала. Кондо стал главковерхом Китайского флота в декабре 1943 и оставался на этом посту до мая 1945, когда он получил место в Высшем военном совете.