Первое землетрясение произошло 14 апреля в 21:26 JST[7].
Эпицентр землетрясения находился на глубине 12 км к северо-западу от центра города Кумамото, наибольшие повреждения были в восточном пригороде Кумамото Масики, где погибли девять человек[8].
В последующие часы произошло по крайней мере 11 подземных толчков, магнитудой не менее 4.5 Mw, один из которых был магнитудой 6 Mw[9], более 140 подземных толчков было зарегистрировано в течение двух дней[10]. Землетрясение ощущались как далеко на север (Симоносеки на Хонсю), так и далеко на юг (Кирисима)[11].
По меньшей мере 10 человек погибли и около 880 были ранены[12]. Замок Кумамото получил повреждения наружных стен и крыши из-за землетрясения и его афтершоков[13]. Украшения сятихоко были уничтожены[14]. Большое количество сооружений были разрушены или загорелись в результате землетрясения. Многочисленные оползни прошли в горах острова Кюсю, что сделало дороги непроходимыми[15]. Больница в Кумамото в значительной степени разрушилась, все пациенты были эвакуированы[16]. В связи с утечкой природного газа поставка газа в Кумамото была прекращена[17].
Более 44 000 человек были эвакуированы из наиболее пострадавших районов[15]. Линия высокоскоростных железных дорог Кюсю-синкансэн была приостановлена после того, как поезд сошёл с рельсов из-за землетрясения[18]. Премьер-министр Синдзо Абэ мобилизовал 3000 личного состава сил самообороны Японии для оказания помощи местным органам власти в проведении поисково-спасательных и восстановительных работ[15].
16 апреля
В 1:25 JST 16 апреля произошло землетрясение магнитудой 7 к северу от Кумамото на острове Кюсю на юго-западе Японии. Землетрясение произошло в результате сдвига на небольшой глубине[20]. Значительный ущерб был нанесён в районах, уже пострадавших от землетрясения 14 апреля после сильных подземных толчков (город Беппу в префектуре Оита).
Было выдано предупреждение о возможном появлении цунами с высотой волны от 0,2 до 1 м[15] около 8:30 утра по местному времени.
Вулкан Асо начал извержение с высотой выбороса до 100 м; неясно, является ли извержение вулкана следствием землетрясения[21]. Кадзухиро Исихара, сотрудник Киотского университета и заместитель председателя Координационного комитета СОУ по прогнозированию извержений вулканов, заявил, что вулкан Асо был активен ранее землетрясения[22], находясь под предупреждением 2-го уровня с 24 ноября 2015 года[23][24].
По крайней мере 24 человек погибли и более 1000 человек получили ранения[15]. Полиция получила более 300 звонков в префектуре Кумамото и более 100 звонков в префектуре Оита от жителей, обращающихся за помощью; многие находились под обломками[25]. Ещё 1600 солдат сил самообороны Японии были направлены для оказания помощи пострадавшим от землетрясения[26].
Город Кумамото остался без воды[27]. Все жители села Нисихара были эвакуированы из-за опасений, что может прорваться расположенная рядом плотина[27].
Храм Асо[англ.] был сильно повреждён в результате землетрясения. Надвратная башня[англ.] храма, официально классифицирующаяся японским правительством как важнейший культурный объект, полностью разрушилась; рухнул и храмовый хайдэн[28].
† показывает, что жертвами землетрясения стали как минимум 30 человек ‡ показывает землетрясение с самым большим количеством жертв В скобках указана магнитуда основного толчка и его дата.