Франсиска Эдвижес Невес Гонзага родилась 17 октября1847 года и была внебрачным ребёнком высокопоставленного офицера (позднее маршала) Жозе Базилеу Невеса Гонзага (порт.Jose Basileu Neves Gonzaga) и мулатки Розы Марии де Лима (порт.Rosa Maria de Lima). Позднее, несмотря на сопротивление семьи, Жозе Базилеу не только признал дочь, но и женился на Розе. Франсиска получила хорошее образование для женщины XIX века, её учили читать, писать, она изучала иностранные языки, математику и катехизис, большое внимание было уделено обучению музыке. Уже в 11 лет она сочинила свою первую песенку.
В 1863 году по желанию отца вышла замуж за предпринимателя Жасинту Ребейру ду Амарал (порт.Jasinto Ribeiro do Amaral). Брак оказался неудачным, так как муж запрещал ей заниматься музыкой. В браке родилось трое детей:
В 1869 году Франсиска окончательно оставила мужа. Она стала первой женщиной в католической Бразилии, добившейся развода. Франсиска попыталась вернуться в дом отца, но он отказался от неё. Её дочь Мария воспитывалась в семье деда и бабки и даже считала их своими родителями, сын Иларио остался в доме мужа.
Она сближается с известным флейтистом Жоакимом Антониу да Силва Каладу (порт.Joaquim Antonio da Slva Callado, 1848—1880), считающегося основателем бразильского музыкального жанра шору, который сочетает африканские и европейские мотивы. Именно Каладу ввёл Франсиску в музыкальный мир, где она стала известна как Шикинья Гонзага (Шикинья — сокращённое имя Франсиска). Он пригласил Франсиску пианисткой в свой ансамбль Choro do Callado и посвятил ей композицию «Любимая всеми» (порт.Querida por Todos, 1865). Чтобы заработать деньги, играет пьесы для фортепиано в музыкальных магазинах и на праздниках, даёт уроки музыки. Её презрительно называют pianeira, в отличие от пианистов (порт.pianistas), исполняющих классические произведения. Шикинья Гонзага как пианистка стала первой женщиной, исполнявшей музыку шору, которая в высшем обществе считалась недостойным жанром.
Отвергнутая семьёй и обществом, Франсиска Гонзага начинает встречаться с молодым инженером Жуаном Батиста де Карвалью (порт.João Batista de Carvalho). Вместе с ним она покинула Рио-де-Жанейро и провела несколько лет в сельской местности. В 1876 году у них родилась дочь Алиси. Но, узнав о неверности Жуана, она оставила его, дочь осталась с отцом. Затем Шикинья с сыном Жуаном Гуалберту возвращается в Рио-де-Жанейро и продолжает прерванную музыкальную карьеру.
В 1877 году к Шикинье приходит первый успех как композитору. Её полька «Завлекательная» (порт.Atraente) пользуется большим успехом. Всего она была автором более 250 композиций: полек, вальсов, 41 пьесы в жанре машише, скрывавшемся под названием «бразильского танго» (tango brasileiro) и существенно отличавшегося от танго, кадрилей, фаду, гавотов.
В 1885 году стала первой в Бразилии женщиной-дирижёром при исполнении одноактной оперы Пальяреса Рибейры порт.A Corte na Roca.
В 1899 году написала песню «Посторонитесь, я хочу пройти» (порт.O Abre Alas), которая стала первой карнавальной песней.
Шикинья Гонзага активно участвовала в политической жизни страны, выступала за отмену рабства в Бразилии, посещала митинги и заседания.
В 1899 году она встретилась с Жуаном Баутисту Фернандесом Лаже. Ей было 52 года, ему — 16. Шикинья представляла его как сына. Роман с ним продлился до её смерти. В 1900-х годах влюблённые совершили путешествие по Европе. Во время путешествия она обнаружила в одном из музыкальных магазинов ноты своих произведений, напечатанные без её согласия. В 1909 году, вернувшись в Бразилию, Шикинья Гонзага начала борьбу за соблюдение авторских прав. В 1916 году Конгресс Бразилии одобрил Гражданский кодекс, включавший закон об авторском праве. В 1917 году Шикинья Гонзага вошла в тогда же основанный Бразильский союз театральных авторов (порт.Sociedad Brasileira de Autores Teatras, SBAT).