Таксон Ancodonta был введён американским палеонтологомУильямом Мэтью в 1929 году[3]. У. Арнасон и коллеги (2001) указывали в составе анкодонтов бегемотовых и парафилетическое вымершее семейство антракотериевых[5]. В 2009 году М. Сполдинг и коллеги ввели кладу Hippopotamidamorpha для обозначения бегемотовых и всех таксонов, более близких к ним, чем к каким-либо другим современным животным, при этом предположив полифилию антракотериевых[7]. Полифилия антракотериевых не была поддержана дальнейшими исследованиями, а таксон Hippopotamidamorpha оказался идентичным Ancodonta по своему составу[8][9].
В филогенетическом анализе М. Орлиака и коллег (2010) вымершее семейство Choeropotamidae было восстановлено как более близкое к бегемотовым, чем к китообразным, и поэтому также может быть включено в состав анкодонтов[8].
↑ 12Arnason U., Gullberg A., Gretarsdottir S. et al. The mitochondrial genome of the sperm whale and a new molecular reference for estimating eutherian divergence dates (англ.) // Journal of Molecular Evolution[англ.]. — 2000. — Vol. 50, iss. 6. — P. 569—578. — ISSN1432-1432. — doi:10.1007/s002390010060.
↑Arnason U., Gullberg A., Gretarsdottir S. et al. The Mitochondrial Genome of the Sperm Whale and a New Molecular Reference for Estimating Eutherian Divergence Dates (англ.) // Journal of Molecular Evolution[англ.]. — 2000. — Vol. 50, iss. 6. — P. 569—578. — ISSN1432-1432. — doi:10.1007/s002390010060.