В 1989—1992 годы — народный депутат СССР. Избран на альтернативной основе и вопреки воле партийного аппарата республики, который активно работал против независимого кандидата Э. Акрамова.
В 1998 году вместе с группой единомышленников основал партию действия «Моя страна» (Менин олком). В 2000 году на очередных парламентских выборах возглавлял партийный список партии «Моя страна» и был избран депутатом, но отказался от депутатского мандата в пользу своих товарищей.
C 15 октября 2007 г. — член народной партии «Ак Жол» (в октябре 2007 года произошло слияние четырёх партий в единую Народную партию «Ак Жол»). На выборах 2007 году входил в первую пятерку партийного списка Народной партии «Ак Жол» и был избран депутатомЖогорку Кенеша 4-го созыва. Состоял членом Комитета по конституционному законодательству, государственному устройству, законности и правам человека; совмещал работу в парламенте с лечебной деятельностью.
«Вся страна почитает Вас как прекрасного учёного, блестящего хирурга, талантливого организатора, одарённого педагога и наставника. Благодарные люди называют Вас „Доктором от Бога“, человеком высокой души, интеллигентности, человеком, посвятившим всего себя служению людям. За свою 56-летнюю врачебную практику Вы провели более 30 тысяч операций. Спасли жизни десяткам тысяч людей, вернули их к семьям, и дали им возможность приносить пользу своему народу и стране».
Глава государства отметил, что начиная с 60-х годов прошлого века, почти два десятилетия Эрнст Акрамов был единственным в стране специалистом в области сосудистой хирургии.
Разработал и внедрил в хирургическую практику многие операции. Подготовил 17 докторов и кандидатов медицинских наук. Участник и организатор международных конференций и симпозиумов. Ведущий специалист по сосудистой, желудочно-кишечной хирургии, реанимации, хирургической гастроэнтерологии, травмам грудной клетки, гнойной хирургии, по реконструктивно-восстановительным операциям на мочевыделительных органах и операциям на поджелудочной железе.
Автор более 350 научных работ, 16 монографий, 23 патентов на изобретения.
Избранные труды
Акрамов Э. Х., Акылбеков И. К., Бородин Ю. И. и др. Избранные вопросы гнойной хирургии. — Бишкек; Новосибирск: НЦРВХ МЗ КР, 2007. — 2644 с. — 300 экз.
Акрамов Э. Х., Бородин Ю. И., Васильева О. И., Габитов В. Х., Штофин С. Г. Анатомия поджелудочной железы и хирургия панкреонекроза. — Бишкек: НЦРВХ МЗ КР, 2009. — 303 с. — 500 экз. — Артикул: 1694-5271-007
Акрамов Э. Х., Габитов В. Х., Бейсембаев А. А. Краткий курс лекций по основам оперативной хирургии и топографической анатомии : в 2-х т. — Бишкек: НЦРВХ МЗ КР, 2012. — 202+227 с. — 2000 экз. — Артикул: 1694-5271-025, 1694-5271-026
Акрамов Э. Х., Габитов В. Х., Идрисов А. А. Хирургическая анатомия гастродуоденальной зоны. Ваготомия и резекции. — Бишкек: НЦРВХ МЗ КР, 2011. — 247 с. — 300 экз. — Артикул: 1694-5271-027
Акрамов Э. Х., Габитов В. Х., Идрисов А. А. и др. Хирургическая анатомия гепато-дуоденальной зоны и резекция желудка: Руководство для врачей. — Бишкек: НЦРВХ МЗ КР, 2010. — 267 с. — 1000 экз. — Артикул: 1694-5271-017
Акрамов Э. Х., Габитов В. Х., Идрисов А. А. Хирургическая анатомия ободочной кишки и варианты оперативных вмешательств: Руководство для врачей. — Бишкек: НЦРВХ МЗ КР, 2010. — 268 с. — 1000 экз. — Артикул: 1694-5271-025
Акрамов Э. Х., Габитов В. Х., Идрисов А. А. Хирургическая анатомия таза и ятрогенные повреждения в гинекологии: Руководство для врачей. — Бишкек: НЦРВХ МЗ КР, 2012. — 244 с. — 1000 экз. — Артикул: 1694-5271-019
Действительный член Международной академии наук (г. Москва)
Золотая медаль Международного благотворительного фонда науки и культуры им. Мустафы Кемаля (Ататюрка) (2000)
Премия «Чародей скальпеля» Международного благотворительного фонда поддержки материнства и детства «Мээрим» (2004)
«Человек года» в СНГ в номинации «Врач 2004 года в Кыргызстане»
Орден «Данакер» (26 января 2003) — за особые заслуги перед государством и народом Кыргызстана, вклад в укрепление дружбы и межнационального согласия в республике[6]
Аникин В. Эрнст Акрамов: Голодный и нищий спортсмен никогда не станет чемпионом // Вечерний Бишкек. — 2011, 11 февраля.
Асанов У. А., Жуманазарова А. З., Чоротегин Т. К. Кто есть кто в кыргызской науке: Краткий биобиблиогр. справочник докторов наук Кыргызстана / Под ред. акад. У. А. Асанова. — Бишкек: Гл. ред. Кыргызск. энциклопедии, 1997.
Ащеулов Д. Будни хирурга. День за днем // Слово Кыргызстана. — 2012, 14 марта.
Иванов А. Не умирай раньше смерти // Слово Кыргызстана. — 2011, 23 сентября.
Иванов А. Эрнст Акрамов : Повесть. — 2-е изд., доп. — Бишкек, 2007. — 416 с. — (Жизнь замечательных людей Кыргызстана). (/ Окончание)
Калашников Л. Акрамовские вечера: и волшебство и благородство // Слово Кыргызстана. — 2012, 16 ноября.
Кыргызская наука в лицах / У. Асанов и др. — Бишкек: Гл. ред. энциклопедии и гос. языка, 2002.
Мешкова Е. Эрнст Акрамов: Хирург должен быть мыслителем // МСН. — 2007, 29 июня.
Курманов Ильяс. Представительная власть кыргызов: сквозь призму веков и мирового опыта. — Берлин: LAP, 2014.- С.81. ISBN 978-3-659-51499-9
Под рук. Жураева Б. Ж. «Во имя процветания Кыргызстана» Энциклопедическое издание о выдающихся узбеках Кыргызстана, 336 стр., «Ризван» город Ош, 2017 год.