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| Subgênero Chaetodon | |
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| Subgênero Citaroedus | |
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| Subgênero Corallochaetodon | |
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| Subgênero Discochaetodon | |
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| Subgênero Exornator | |
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| Subgênero Gonochaetodon | |
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| Subgênero Lepidochaetodon | |
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| Subgênero Megaprotodon | |
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| Subgênero Radophorus | |
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| Subgênero Rhombochaetodon | |
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| Subgênero Tetrachaetodon | |
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