Posto que a coenzima A é quimicamente um tiol, pode reagir com os ácidos carboxílicos para formar tioésteres, de modo que atue como um portador de grupo acilo. Uma molécula de coenzima A que leva um grupo acetilo é referida como Acetil-CoA. Quando não está unida a um grupo acetilo é referida geralmente como "CoASH" o "HSCoA".
Quando a Coenzima A se une ao Acetil, ela permite que ele seja degradado pelas enzimas do ciclo de krebs, o qual ocorre posteriormente a degradação da mesma