A competição foi dividida em duas zonas: "Zona Norte" e "Zona Sul".
Zona Norte
A Zona Norte foi composta de dois grupos de quatro times cada, onde os dois primeiros e os dois segundos colocados de cada grupo se classificaram para as semifinais da fase norte. O Talento Dorado, campeão da Zona Norte, estava classificado para a fase final.[4][5][6][7][8]
Zona Sul
A Zona Sul foi composta de dois grupos de cinco times cada, onde os dois primeiros e os dois segundos colocados de cada grupo se classificaram para as semifinais da fase sul. O campeão da Zona Sul, estava classificado para a fase final.[8]
Fase Final
Na fase final se enfrentaram o campeão da Zona Norte e o campeão da Zona Sul, em dois jogos na casa do campeão da Zona Sul. Caso alguma das equipes não comparecer, será declarada campeã a equipe que tenha confirmado a sua participação.[1]
↑ abWbeimar Lo Dice (31 de maio de 2013). «"Tercera fecha de la Copa Merconorte Futsal Valera 2013"» (em espanhol). Wbeimar Lo Dice. Consultado em 9 de dezembro de 2013Erro de citação: Código <ref> inválido; o nome "TerceraFechaCopaMerconorte" é definido mais de uma vez com conteúdos diferentes