As 8 equipes se enfrentam em dois turnos. No primeiro turno as equipes se enfrentam em partidas de ida e as duas melhores fazem a final, valendo vaga para a Série D 2016. Já no segundo turno, o campeão garante vaga para a Copa Verde 2017.
Após as duas fases, será realizada a final da competição com os campeões dos dois turno se enfrentando em partidas de ida e volta. Caso o vencedor dos 1º e 2º turnos seja o mesmo, ele será o campeão Rondoniense 2016. Ao campeão da competição cabe a vaga na Copa do Brasil 2017.
Primeiro Turno – Classificatória– Nessa Fase, as Associações jogarão em jogos de ida, classificando-se os dois primeiros colocados para a final do turno, onde o campeão garanti vaga na Grande final do estadual.
Segundo Turno – Classificatória– Nessa Fase, as Associações jogarão em jogos de volta em relação ao Primeiro Turno, classificando-se os dois primeiros colocados para a final do turno, onde o campeão garanti vaga na Grande final do estadual.
Grande Final – Nessa Fase as duas equipes campeãs do primeiro e segundo turno decidem o título em dois jogos, se um mesmo clube vencer os dois turno é declarado campeão estadual 2016.
Critério de desempate
Os critério de desempate foram aplicados na seguinte ordem:
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