Encerrou suas atividades esportivas em 21 de março de 2013 quando desistiu de participar do Campeonato Cearense de Futebol pela 2ª divisão e voltou pro futebol municipal.
História
A história do Boa Viagem EC tem início na década de 1980. Naquela época a seleção do município foi inscrita em uma competição Intermunicipal realizada pela Associação Profissional dos Cronistas Desportistas do Estado do Ceará.
Em 1983 o clube, que ainda não era profissional, chegou à final da competição, todavia não conseguiu conquistá-la, foi derrotado na final pela equipe de Itapipoca pelo placar de 1 a 0. Quatorze anos depois, em 1997, o sonhado título tornou-se realidade, o Boa Viagem venceu a equipe de Maranguape na final da competição e tornou a repetir a façanha em 1998, quando conseguiu derrotar na final o selecionado de Aracati.
Com a conquista do Torneio Intermunicipal o Boa Viagem Esporte Clube garantiu o direito de disputar a Segunda Divisão do Campeonato Cearense de 2000. Diante disso, a sociedade do Município de Boa Viagem se organizou em torno do clube e, com apoio da prefeitura municipal, foi fundado o Boa Viagem Esporte Clube.
Em 2000, disputando pela primeira vez uma competição profissional, o Boa Viagem consegue o acesso a 1ª Divisão do Campeonato Cearense de Futebol. Nesta oportunidade, sua estreia foi contra a equipe do Limoeiro, no dia 19 de março de 2000, naquele dia, diante de sua torcida, o Boa Viagem derrotou a equipe rival pelo placar de 3 a 0.
Em 2010, entretanto a equipe foi rebaixada para a Segundona Cearense ao ser goleado pelo Fortaleza por 4 a 0.
Na ocasião o Clube foi punido e de lá para cá não houve mais participações em competições estaduais, na época o clube alegava que os vereadores do município negaram ajuda econômica ao Boa Viagem Esporte Clube (ao não aprovarem na Câmara a liberação de recursos para a equipe), o que teria impedido a Prefeitura de ajudar a equipe.
Símbolos
Mascote
O Mascote do Boa Viagem Esporte Clube é o Galo, chamado carinhosamente pela torcida de "Galo do Sertão".
Uniformes
As cores do uniforme do Boa Viagem é o azul e o branco Seu 1º uniforme é feito por camisa listrada horizontal em azul e branco, calção e meiões azuis.
O 2º uniforme é todo branco.
Estádio
O Boa Viagem manda seus jogos no Estádio Serjão, com capacidade para cerca de 4.000 torcedores.