Azhdarchoidea recebeu uma definição filogenética de David Unwin em 2003. Unwin definiu o grupo como o ancestral comum mais recente de Quetzalcoatlus e Tapejara, e todos os seus descendentes.[2]
Tem havido várias visões concorrentes de relacionamentos deste clado. O primeiro, apresentado por Felipe Pinheiro e colegas em 2011, considerou o Tapejaridae como um clado monofilético incluindo os grupos Thalassodrominae e Chaoyangopteridae.[3] O segundo, encontrado por Naish & Martill (2006), assim como Lü et al. (2008), considerou os Tapejaridae tradicionais um grau parafilético de Azhdarchoidea, mas mais primitivos, com os verdadeiros membros do primeiro clado mais basais, e os Thalassodrominae e Chaoyangopteridae sendo sucessivamente mais próximos aos Azhdarchoidea.[4] Todos os membros deste clado que fazem parte do mesmo que é formado por Quetzalcoatlus e Tupuxuara e estão incluídos no grupo Neoazhdarchia conforme definido por Unwin em 2003.[2]
Em 1996, Alexander Kellner criou um clado diferente chamado Tapejaroidea, que ele definiu como o ancestral comum mais recente e todos os descendentes de Tapejara, Quetzalcoatlus e Dsungaripterus. Kellner criou este clado para incluir Azhdarchoidea e a família Dsungaripteridae, mas como grupos separados..[5][6] Muitos estudos recentes seguiram esse conceito.[7][8][9][10]
Existem teorias concorrentes de filogenia deste clado, é considerado como intimamente relacionado ao clado Ctenochasmatoidea,,[2][11] ou dentro do grupo Ornithocheiroidea, como o táxon irmão de Pteranodontoidea ou dentro do clado Tapejaroidea. Os dois últimos são mais amplamente aceitos.[12][8][10][9] Abaixo está um cladograma que mostra os resultados de uma análise filogenética apresentada por Andres e colegas em 2014. Este estudo encontrou um agrupamento de tapejarídeos na base do clado, com talassodrominas mais intimamente relacionadas a azdarquídeos e chaoyangopterídeos, bem como dsungaripterídeos. Seu cladograma é mostrado abaixo.[12]
O resultado de uma análise filogenética mais recente, por Kellner e colegas em 2019, havia recuperado Azhdarchoidea dentro do grupo maior Tapejaroidea. Ao contrário da análise de Andres e colegas, Kellner e colegas consideraram que Azhdarchoidea consistia em apenas três grupos: Azhdarchidae, Chaoyangopteridae e Tapejaromorpha. Seu cladograma é mostrado abaixo.[10]
↑ abUnwin, David M.; Heinrich, Wolf-Dieter (1999). «On a pterosaur jaw from the Upper Jurassic of Tendaguru (Tanzania)». Mitteilungen aus dem Museum für Naturkunde in Berlin, Geowissenschaftliche Reihe (em inglês). 2: 121–134
↑ abcUnwin, D. M., (2003). "On the phylogeny and evolutionary history of pterosaurs." Pp. 139-190. in Buffetaut, E. & Mazin, J.-M., (eds.) (2003). Evolution and Palaeobiology of Pterosaurs. Geological Society of London, (em inglês) Special Publications 217, Londres, 1-347.
↑Pinheiro, F.L., Fortier, D.C., Schultz, C.L., De Andrade, J.A.F.G. and Bantim, R.A.M. (in press). "New information on Tupandactylus imperator, with comments on the relationships of Tapejaridae (Pterosauria)." Acta Palaeontologica Polonica, in press, available online 03 Jan 2011. doi:10.4202/app.2010.0057
↑Lü, J.; Unwin, D.M.; Xu, L.; Zhang, X. (2008). «A new azhdarchoid pterosaur from the Lower Cretaceous of China and its implications for pterosaur phylogeny and evolution». Naturwissenschaften (em inglês). 95 (9): 891–897. Bibcode:2008NW.....95..891L. PMID18509616. doi:10.1007/s00114-008-0397-5
↑Kellner, A.W.A. (1996). «Description of new material of Tapejaridae and Anhangueridae (Pterosauria, Pterodactyloidea) and discussion of pterosaur phylogeny». Columbia University (em inglês)
↑Buffetaut, Eric; Mazin, Jean-Michel (2003). Evolution and Palaeobiology of pterosaurs (em inglês). [S.l.]: Geological Society of London. ISBN9781862391437A referência emprega parâmetros obsoletos |publicado por= (ajuda)
↑ abBorja Holgado, Rodrigo V. Pêgas, José Ignacio Canudo, Josep Fortuny, Taissa Rodrigues, Julio Company & Alexander W.A. Kellner, 2019, "On a new crested pterodactyloid from the Early Cretaceous of the Iberian Peninsula and the radiation of the clade Anhangueria", Scientific Reports9: 4940 doi:10.1038/s41598-019-41280-4
↑ abcKellner, Alexander W. A.; Weinschütz, Luiz C.; Holgado, Borja; Bantim, Renan A. M.; Sayão, Juliana M. (19 de agosto de 2019). «A new toothless pterosaur (Pterodactyloidea) from Southern Brazil with insights into the paleoecology of a Cretaceous desert». Anais da Academia Brasileira de Ciências (em inglês). 91 (suppl 2): e20190768. ISSN0001-3765. PMID31432888. doi:10.1590/0001-3765201920190768
↑ abAndres, B.; Clark, J.; Xu, X. (2014). «The Earliest Pterodactyloid and the Origin of the Group». Current Biology (em inglês). 24 (9): 1011–6. PMID24768054. doi:10.1016/j.cub.2014.03.030