Het taekwondotoernooi in de klasse tot 49 kilogram voor vrouwen op de Olympische Zomerspelen 2016 vond plaats op woensdag 17 augustus 2016. Regerend olympisch kampioene was Wu Jingyu uit China; zij kwam tijdens deze Spelen in actie en kon derhalve haar titel verdedigen. De taekwondoka's vochten in een knock-outsysteem, dat na drie rondes in een finale uitmondde. Elke taekwondoka die van een van de finalisten verloor werd geplaatst in een herkansing; de verliezers van de halve finales vochten tegen de winnaars van deze herkansingen, wat twee bronzen medailles opleverde.
Toernooischema
Hoofdtoernooi
Herkansingen