In de begintijd van het station kon men per paardenomnibus in het deel van de stad aan de andere kant van de Oder komen (het huidige Słubice). In 1898 werd Frankfurt voorzien van een tram.[4]
Tussen 1922 en 1924 werd er een nieuw stationsgebouw gebouwd en het oude gesloopt. Het stationsgebouw dat toen werd gebouwd, is anno 2024 nog steeds in gebruik. Van 1998 tot 2003 werd het station verbouwd.