Kipyego's vader stierf toen ze vier jaar oud was. Hierdoor moest haar moeder in haar eentje zorg dragen voor een gezin van zeven kinderen. Twee andere kinderen werden ook professioneel atleet, namelijk: Michael Kipyego (steeplechase en lange afstand) en Christopher Chipsiya (marathon).
In 2001 maakte Kipyego haar internationale doorbraak door in Oostende achtste te worden op de wereldkampioenschappen veldlopen voor junioren. Met het Keniaanse team veroverde ze een zilveren medaille. Van 2002 tot 2004 kon ze geen topsport bedrijven vanwege een stressfractuur in haar been. Van 2005 tot 2006 studeerde ze aan het South Plains College en hierna aan de Texas Tech University, waar ze een opleiding tot verpleegster volgde. In haar tijd aan de Texas Tech werd ze negenmaal NCAA-kampioene. Na haar studie sloot ze zich aan bij de Oregon Track Club Elite.
Kipyego kwalificeerde zich in 2011 als tweede Keniaanse voor de wereldkampioenschappen in Daegu. Daar veroverde ze een zilveren medaille op de 10.000 m achter landgenote Vivian Cheruiyot. Linet Masai, die de bronzen medaille in de wacht sleepte, maakte de Keniaanse clean sweep compleet.