Trimen reisde in 1859 naar Zuid-Afrika, waar hij op het kantoor van hoofdauditeurEdgar Leopold Layard: ging werken in Kaapstad en vervolgens op het kantoor van de Colonial Secretary. In 1872 werd hij conservator van het Zuid-Afrikaanse Museum in Kaapstad, als opvolger van Layard. Hij voegde daar als eerste prehistorischerelikwieën toe aan de collectie. Trimen bleef in functie totdat hij in 1895 wegens gezondheidsproblemen terug moest treden, maar niet voordat er op zijn initiatief een nieuw, ruimer gebouw gebouwd werd. In 1880 nam hij deel aan het internationale congres over in Bordeaux over de druifluis.