De deelnemers namens Nederland aan het Junior Eurovisiesongfestival worden jaarlijks bepaald in de finale van het Junior Songfestival. Duizenden kinderen schrijven zich jaarlijks in met een zelfgeschreven liedje om te proberen een deelname te bemachtigen aan de audities. Een jury bepaalt uiteindelijk wie er mag deelnemen aan de halve finales die worden uitgezonden op televisie (in 2003 en 2006 waren er geen halve finales, toen gingen de door de jury gekozen kandidaten rechtstreeks naar de finale). In beide halve finales winnen twee deelnemende acts rechtstreeks toegang tot de finale. Het publiek kan via een stemronde op het internet bepalen welke act dan alsnog, via de zogenaamde wildcard, wordt toegelaten tot de finale (in 2004 en 2005 werd de wildcard uitgereikt door de vakjury). De winnaar van de finale mag namens Nederland meedoen aan het Junior Eurovisiesongfestival. Zowel in de halve finales als in de finale worden punten toegekend door een vakjury, een kinderjury (sinds 2004) en het publiek om de uitslag te bepalen.
Van 2004 t/m 2015 zongen de finalisten van het Junior Songfestival ook elk jaar een gezamenlijk nummer. In 2019 was dit weer teruggehaald.
In 2016 werd het Junior Songfestival niet gehouden. In plaats daarvan vond voor het eerst een interne selectie plaats. Op internet was te volgen wie Nederland zou gaan vertegenwoordigen op het Junior Eurovisiesongfestival in Malta. Deelnemers deden mee met een zelfgekozen cover van een Nederlands JSF-nummer van de vorige jaren.
In 2017 werd er wel een Junior Songfestival gehouden, maar deze week zeer sterk af van eerdere edities. De programma's, twee halve finales en een finale, waren van tevoren opgenomen. De deelnemers zongen er covers en de winnaar werd bepaald door een vakjury. Naderhand werd er voor de winnende boyband Fource een lied geschreven waarmee ze Nederland vertegenwoordigen op het Junior Eurovisiesongfestival.
In 2018 was er weer een live-uitzending waarin de deelnemers elk een eigen lied lieten horen. Het grootste verschil in vergelijking met de periode 2003-2015 zit er echter in hoe deze liedjes zijn ontstaan. Voorheen deden kinderen auditie met een zelf geschreven lied, en als ze wonnen mochten ze dat lied laten horen op het Junior Eurovisiesongfestival. Tegenwoordig doen de kinderen auditie met covers en mogen na de audities geen liedjes schrijven.
In 2017 vertegenwoordigden Lisa, Amy en Shelley Vol (O'G3NE) Nederland op het Eurovisiesongfestival. Dit was tien jaar nadat zij hadden deelgenomen aan het Junior Songfestival. Ze behaalden de elfde plek in de finale.
In 2021 vertegenwoordigde Stefania Griekenland op het Eurovisiesongfestival. Dit was vijf jaar nadat ze deelnam aan het Junior Songfestival als lid van de meidengroep Kisses. Ze behaalde de tiende plek in de finale.
↑(en) Nahabedian, Mikael, Shalisa Wins Junior Songfestival 2015!. ESCBubble (3 oktober 2015). Gearchiveerd op 7 oktober 2015. “The professional jury members were: Gerard Joling, Yes-R and Leona Philippo.”
· 
· 
