Taniguchi begon zijn carrière als assistent voor mangaka Kyota Ishikawa. Hij maakte zijn debuut in 1970 met Kareta Heya. Het werk werd gepubliceerd in het magazine Young Comic.
Van 1978 tot 1986 maakte hij samen met scenarist Natsuo Sekigawa strips zoals City Without Defense, The Wind of the West is White en Lindo 3. Van 1987 tot 1996 creëerden ze samen de vijfdelige reeks getiteld Botchan no Jidai. In de jaren 1990 gaf hij verscheidene albums uit, waaronder Aruku Hito (歩くひと), Chichi no Koyomi (父の暦) en Hitobito Shirīzu: Keyaki no Ki (人びとシリーズ「けやきのき」).
Tussen 1980 en 1983 werkte hij samen met Garon Tsuchiya aan de manga Blue Fighter (青の戦士, Ao no Senshi), Knuckle Wars (ナックル・ウォーズ, Nakkuru Wōzu) en Live! Odyssey (LIVE! オデッセイ).
Taniguchi verzorgde de illustraties van Baku Yumemakura’s werk van 1989 tot 1990. Dit waren onder meer Kamigami no itadaki en Garouden. Kamigami no itadaki won verscheidene prijzen op het Internationaal stripfestival van Angoulême in 2002 en 2005.
In 1997 maakte hij de Ikaru (Icarus) reeks op teksten van Jean Giraud.
↑Guillermo del Toro [@RealGDT] (14 February 2017). "Jiro Taniguchi was a manga poet. The Kieslowski of the page. A serene, profound observer of the world" (Tweet). Geraadpleegd op 20 februari 2017 – via Twitter.
