Helminthostachys vormt, volgens onderzoek uit 2003 naar de nucleotidensequentie van het rbcL- en het trnL-F-gen, een monofyletische clade, naast de andere geslachten van de Ophioglossales.[1]
Sommige auteurs plaatsen het geslacht in de aparte familie Helminthostachyaceae, maar de recente (2006) classificatie van Smith en anderen houdt het bij één overkoepelende familie, Ophioglossaceae.[2]
Het geslacht is monotypisch, het omvat slechts één soort.