Het seizoen 1968/1969 was het 15e jaar in het bestaan van de Eindhovense betaald voetbalclub Eindhoven. De club kwam uit in de Eerste divisie en eindigde daarin, na een beslissingswedstrijd tegen De Volewijckers op de 16e plaats, dit betekende dat de club rechtstreeks degradeerde naar de Tweede divisie. Tevens deed de club mee aan het toernooi om de KNVB Beker, hierin werd in de eerste ronde verloren van Volendam (0–1).