In 1999 werd het 85ste Campeonato Pernambucano gespeeld voor voetbalclubs uit de Braziliaanse staat Pernambuco. De competitie werd georganiseerd door de FPF en werd gespeeld van 24 januari tot 12 juli. Sport werd kampioen.
Indien een club gelijk speelde en gescoord had die wedstrijd kregen ze twee punten, bij een scoreloos gelijkspel krijgen ze één punt.