De Boston Marathon 2009 vond plaats op maandag 20 april 2009. Het was de 113e editie van deze marathon.
Was in de drie voorafgaande afleveringen de overwinning steeds naar Kenia gegaan in de persoon van Robert Kipkoech Cheruiyot (nu vijfde), ditmaal was de hoogste eer weer eens weggelegd voor een Ethiopiër. Deriba Merga zegevierde in editie 2009 in een tijd van 2:08.42. Als beste Keniaan werd Daniel Rono tweede in 2:09.32, gevolgd door de AmerikaanRyan Hall in 2:09.40.
Bij de vrouwen waren de rollen precies omgedraaid. Moest de winnares van vorig jaar Dire Tune uit Ethiopië hard sprinten om zich de RussinAlevtina Biktimirova van het lijf te houden, ditmaal legde zij het in opnieuw een felle eindsprint af tegen de Keniaanse Salina Kosgei. Kosgei finishte in 2:32.16, één seconde voor Tune, terwijl Kara Goucher derde werd in 2:32.25.