Daarnaast gaf Prokop leiding aan de finale van de strijd om de Europa-Supercup-Finale (1) 1979 tussen Nottingham Forest en FC Barcelona (1-0), en aan de eindstrijd van de UEFA Cup in 1981 tussen Ipswich Town en AZ Alkmaar (3-0). Hij kwam in opspraak omdat hij banden zou onderhouden met de Stasi in Oost-Duitsland. Prokop leidde in totaal 27 interlands en 60 Europa-Cupwedstrijden gedurende zijn carrière. Tussen 1958 en 1988 leidde hij daarnaast 283 duels in de hoogste afdeling van Oost-Duitsland, de DDR-Oberliga.