プロテインG (Protein G)は免疫グロブリン に結合するタンパク質 で、C群およびG群のレンサ球菌 によって作られる。プロテインA (英語版 ) とよく似ているが、特性は異なる。細胞表面にあるタンパク質で、分子量は65kDa(G148プロテインG)と58kDa(C40プロテインG)である[ 1] 。FabとFc領域が結合した抗体の精製することにより見出された。血清アルブミンは抗体源によく混入していて、天然のプロテインGはアルブミン にも結合するが、組換え型のプロテインGではアルブミン 結合部位が除去されている。
他の抗体結合タンパク質
プロテインGの他に、プロテインA (英語版 ) 、プロテインA/G (英語版 ) 、プロテインL (英語版 ) など免疫グロブリン結合性の細菌由来タンパク質があり、いずれも免疫グロブリンの精製、固定化、検知を行う上でよく用いられる。それぞれの免疫グロブリン結合性タンパク質は、抗体に認識される部位や結合する抗体の種・型という点から見て異なる抗体結合特性を持っている。
プロテインG B1ドメインの折りたたみ
プロテインG B1ドメインに対する非経験的分子軌道法 により、以前から提唱されていた以下のことが実証された。このタンパク質は、小さな調整が加えられた疎水性 の中心残基 において核生成 が起こることにより折りたたみが始まる。折りたたみ過程は以下のように行われる[ 2] 。
βヘアピン が形成され、43番のトリプトファン(W43)、45番のチロシン(Y45)、52番のフェニルアラニン(F52)の各アミノ酸残基によって安定化される。
αヘリックス 内にある残基30番のフェニルアラニン(F30)と、βヘアピン内の残基が接触して構造が強化される。
βシート の核形成が5番のロイシン(L5)とF52より始まる。
最後の核形成残基となる3番のチロシン(Y3)がβシート中央部分の形成を助け、球状タンパク質 ができあがる。
プロテインG B1ドメイン(別名 GB1)は、NMR など溶液を使った実験中において、他のドメインを溶液中で維持する目的で融合タンパク質 の一部分にしばしば用いられる。これによりこれまで溶かすことができなかったドメインが、GB1と融合させることによって溶けるようになった[ 3] 。
このドメインは56残基のアミノ酸でできている。GB1の分子量は約8kDaだが、SDS-PAGE 電気泳動では約13.5kDaを示す位置まで移動する[要出典 ] 。
参照文献
^ Sjobring U, Bjorck L, Kastern W, et al (1991). “Streptococcal protein G. Gene structure and protein binding properties”. J Biol Chem 266 (1): 399-405. PMID 1985908 .
^ Kmiecik S, Kolinski A (Feb 2008). “Folding pathway of the b1 domain of protein G explored by multiscale modeling” . Biophys J 94 (3): 726-36. doi :10.1529/biophysj.107.116095 . PMC 2186257 . PMID 17890394 . http://scivee.tv/node/3303 .
^ Yuan Cheng, Dinshaw J Patel, An efficient system for small protein expression and refolding, Biochemical and Biophysical Research Communications, Volume 317, Issue 2, 30 April 2004, Pages 401-405