McKenna and Bell[8]はビーバー科をCastoroidinae亜科とCastorinae亜科に分けた。より最近の研究[4][5]では、基盤的分類群としてさら2亜科、Agnotocastorinae亜科とPalaeocastorinae亜科を認めており、本項の分類はこれに従っている。ビーバー科の中で、Castoroidinae亜科とCastorinae亜科は姉妹群であり、他の2亜科よりも近い共通祖先を持っている。両亜科とも、ダムを造ることができる半水生種が含まれる[4]。Palaeocastorinae亜科には穴を掘ると考えられている[4]Migmacastor属などが含まれる[9]。以下の分類はKorth[5][9][10]とRybczynski[4]による。(両者が異なる場合、後者を優先させた。)
^ abcdeRybczynski, N. (27 December 2006). “Castorid phylogenetics: implications for the evolution of swimming and tree-exploitation in beavers”. Journal of Mammalian Evolution14 (1): 1-35. doi:10.1007/s10914-006-9017-3.
^ abcKorth, W.W. (December 2001). “Comments on the systematics and classification of the beavers (Rodentia, Castoridae)”. Journal of Mammalian Evolution8 (4): 279–296. doi:10.1023/A:1014468732231.
^Palmer, D., ed (1999). The Marshall Illustrated Encyclopedia of Dinosaurs and Prehistoric Animals. London: Marshall Editions. pp. 284. ISBN1-84028-152-9
^Savage, R.J.G., and Long, M.R. 1986. Mammal Evolution: an Illustrated Guide. Facts on File, New York, pp. 120–121 ISBN0-8160-1194-X.
^McKenna, Malcolm C., and Bell, Susan K. 1997. Classification of Mammals Above the Species Level. Columbia University Press, New York, 631 pp. ISBN0-231-11013-8.
^ abKorth W.W., 2007b. The skull of Nothodipoides (Castoridae, Rodentia) and the occurrence of fossorial adaptations in beavers Journal of Paleontology 81(6):1533-1537.
^Korth W.W., 2007a. A new genus of beaver (Rodentia, Castoridae) from the Miocene (Clarendonian) of North America and systematics of the Castoroidinae based on comparative cranial anatomy Annals of Carnegie Museum 76(2):117-134.