Il teatro venne fondato come Opernhaus am Brühl il 18 maggio 1693 con la prima assoluta di Alceste di Nicolaus Adam Strungk, terzo teatro d'opera a sorgere in Europa dopo il Teatro San Cassiano di Venezia e l'Opera di Amburgo in Germania. L'Opera di Lipsia non ha una sua orchestra, e la Leipzig Gewandhaus Orchestra viene impiegata nella stagione operistica del teatro. Questa collaborazione data dal 1766, con l'esecuzione dello SingspielDer Teufel ist los oder Die verwandelten Weiber di Johann Adam Hiller.
Durante un bombardamento aereo, nella notte del 3 dicembre 1943, il teatro venne distrutto, così come tutti gli altri teatri di Lipsia.
La costruzione del nuovo teatro ebbe inizio nel 1956 e la sua inaugurazione, con 1.682 posti, ebbe luogo l'8 ottobre 1960, con una rappresentazione de I maestri cantori di Norimberga di Wagner.