La Mestaruussarja 1988 fu la settantanovesima edizione della massima serie del campionato finlandese di calcio, la cinquantottesima come Mestaruussarja. Il campionato, con il formato nuovamente a doppia fase e composto da dodici squadre, venne vinto dall'HJK per la seconda edizione consecutiva.
Due punti a vittoria, uno a pareggio, zero a sconfitta.
Seconda fase
Fase per il titolo
Alla fase per il titolo accedevano le squadre classificatesi dal primo al sesto posto della prima fase, portando tutti i punti conquistati al termine della prima fase.
Due punti a vittoria, uno a pareggio, zero a sconfitta.
Fase per la salvezza
Alla fase per la salvezza accedevano le squadre classificatesi dal settimo al dodicesimo posto della prima fase, portando tutti i punti conquistati al termine della prima fase.
Due punti a vittoria, uno a pareggio, zero a sconfitta.
Spareggio promozione/retrocessione
Lo spareggio promozione/retrocessione venne disputato dall'undicesima classificata in Mestaruussarja (il KuPS) e dalla seconda classificata in I divisioona (il MyPa). La vincente era ammessa alla Mestaruussarja 1989, mentre la perdente veniva ammessa alla I divisioona 1989.