L'MTV Europe Music Award al miglior artista alternative (MTV Europe Music Award for Best Alternative) è uno dei premi degli MTV Europe Music Awards, che viene assegnato dal 1997. Nelle varie edizioni dei premi, la categoria è stata discontinua negli anni: non è stata presente dal 1998 al 2003, e ancora dal 2007 al 2009.
Il maggior numero di vittorie è stato ottenuto dai Thirty Seconds To Mars, con un totale di 4 (di cui 2 consecutive), seguiti da Lana Del Rey, con un totale di 2.
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