Boudier, É. (1869). Mémoire sur les Ascobolées. Annales des Sciences Naturelles, Botanique, sér. 5 10: 191-268.
Boudier, É. (1877). De quelques espèces nouvelle de champignons. Bull. Soc. Bot. France24: 307-314.
Boudier, É. (1879). Diagnoses nouvelles de quelques espèces critiques de champignons. Bull. Soc. Bot. France26: 228-236.
Boudier, É. (1881). Nouvelles espèces de champignons de France. Bull. Soc. Bot. France28: 91-[93], tab.
Boudier, É. (1885). Note sur un nouveau genre et quelques nouvelles espèces des Pyrenomycètes. Revue Mycologique Toulouse7: 224-[226], tab.
Boudier, É. (1885). Nouvelle classification naturelle des Discomycètes charnus. Bull. Soc. Mycol. France1: 91-120.
Boudier, É. (1885). Description de quelques espèces nouvelles de champignons basidiosporés. Bull. Soc. Bot. France32: 282-[283].
Boudier, É. (1887). Notice sur les discomycètes figurés dans les dessins inédits de Dunal. Bull. Soc. Mycol. France3: 88-96.
Boudier, É. (1888). Nouvelles espèces de Discomycètes inoperculès de France. Bull. Soc. Mycol. France4: 76-86, 1 pl..
Boudier, É. (1891). Quelques nouvelles espèces de champignons inférieurs. Bull. Soc. Mycol. France7: 81-83, tab.
Boudier, É. (1891). Trois nouvelles espèces de Pezizes. Bull. Soc. Mycol. France7: [215].
Boudier, É. et Patouillard, N.T. (1892). Description de deux nouvelles espèces de Gymnoascus de France. Bull. Soc. Mycol. France8: 43-45, 1 pl..
Boudier, É. (1896). Description de quelques nouvelles espèces de Discomycètes de France. Bull. Soc. Mycol. France12: 11-17, pls. 3-4.
Boudier, É. (1897). Nouvelles espèces ou variétés de champignons de France. Bull. Soc. Mycol. France13 (1): 9-18, pls 1-4.
Boudier, É. (1897). Révision analytique des morilles de France. Bull. Soc. Mycol. France13 (2): 129-153.
Boudier, É. (1898). Descriptions et figures de quelques espèces de Discomycètes operculés nouvelles ou peu connues. Bull. Soc. Mycol. France14: 16-23, pls. 3-4.
Boudier, É. (1898). Description d'une nouvelle espèce de morille de France, le Morchella Reilana. Ann. Soc. Bot. Lyon23: 85-87.
Boudier, É. (1899). Note sur quelques champignons nouveaux des environs de Paris. Bull. Soc. Mycol. France15: 4-54.
Boudier, É. et Patouillard, N.T. (1900). Note sur deux champignons hypogés. Bull. Soc. Mycol. France16: 141-146, 1 pl..
Boudier, É. (1901). Note sur le genre Perrotia, nouveau genre de Discomycètes operculés. Bull. Soc. Mycol. France17: 23-25.
Boudier, É. (1902). Champignons nouveaux de France. Bull. Soc. Mycol. Fr.18: 137-146, 3 plates.
Boudier, É. (1904-1905, publ. 1905). Icones Mycologicae 1-5 [Série 1]: pls. 1-100. Paris; Paul Klincksieck.
Boudier, É. (1905-1906, publ. 1906). Icones Mycologicae 6-10 [Série 2]: pls. 101-200. Paris; Paul Klincksieck.
Boudier, É. (1906-1907, publ. 1907). Icones Mycologicae 11-15 [Série 3]: pls. 201-300. Paris; Paul Klincksieck.
Boudier, É. (1907). Histoire et Classification des Discomycètes d'Europe. 223 pp. Paris; Librairie des Sciences Naturelles Paul Klincksieck.
Boudier, É. (1907-1908, publ. 1908). Icones Mycologicae 16-20 [Série 4]: pls. 301-400. Paris; Paul Klincksieck.
Boudier, É. (1908, publ. 1909). Note sur une nouvelle espèce de Pseudophacidium. Transactions of the British Mycological Society3: 81.
Boudier, É. (1908-1909, publ. 1909). Icones Mycologicae 21-25 [Série 5]: pls. 401-500. Paris; Paul Klincksieck.
Boudier, É. (1909-1910, publ. 1910). Icones Mycologicae 26-30 [Série 6]: pls. 501-600. Paris; Paul Klincksieck.
Boudier, É. et Torrend, C. (1911). Discomycètes nouveaux de Portugal. Bull. Soc. Mycol. France27: 127-136, tab.