Abbayes fu professore all'Università di Rennes, ove tenne la cattedra di Botanica e fu direttore del Dipartimento di Botanica.
Fu un esperto della flora della Bretagna[1] e di licheni, dominio in cui rimane tuttora uno dei punti di riferimento. Dal 1930 al 1960 costituì un erbario proprio riguardante i licheni[2].
Abbayes è altresì noto per le sue traduzioni di opere greche e latine, che tuttora sono utilizzate da numerosi manuali scolastici.
La carriera scientifica di des Abbayes fu strettamente associata alla città di Rennes, dove una via è intitolata a lui[2], e alla Bretagna.
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