Fattore R

Il fattore R o fattore-R in cristallografia (chiamato anche fattore residuale o fattore di affidabilità o valore-R o indice R o ancora R_Work) è la misura della discrepanza fra il modello cristallografico e i dati sperimentali ottenuti con la diffrazione dei raggi X. In altre parole, è una misura di quanto bene la struttura raffinata riesca a prevedere i dati osservati.[1] È definito dalla seguente equazione:

${\displaystyle R={\frac {\sum {||F_{\text{oss}}|-|F_{\text{calc}}||}}{\sum {|F_{\text{oss}}|}}}}$

dove F è il cosiddetto fattore di struttura e la somma si estende rispettivamente a tutte le riflessioni misurate ed alle controparti calcolate. Il fattore di struttura F è strettamente correlato all'intensità delle riflessioni che descrive:

${\displaystyle I_{hkl}\propto |F(hkl)|^{2}}$

Per le molecole di grandi dimensioni, il fattore-R di solito è compreso fra 0,6 (quando un insieme casuale di riflessioni viene paragonato con un modello dato) e 0,2 (per esempio per un modello di macromolecola ben rifinito alla risoluzione di 2,5 Ångström). Le molecole più piccole (fino a 300 atomi) solitamente formano cristalli più ordinati che le molecole grandi, è quindi possibile raggiungere dei fattori-R più bassi. Nel Cambridge Structural Database più del 95% degli oltre cinquecentomila cristalli censiti ha un fattore R minore di 0,15 e il 9,5% ha un fattore-R minore di 0,03.

I cristallografi utilizzano anche il fattore-R_Free (${\displaystyle R_{Free}}$)[2] per descrivere la qualità di un modello.

I valori ${\displaystyle R_{\text{sym}}}$ e ${\displaystyle R_{\text{merge}}}$ sono usati analogamente per descrivere l'accordo interno delle misure di un insieme di dati cristallografico.

Note

1. A. L. Morris, MacArthur M. W., Hutchinson E. G., Thornton J. M., Stereochemical quality of protein structure coordinates, in Proteins, vol. 12, n. 4, aprile 1992, pp. 345–64, DOI:10.1002/prot.340120407, PMID 1579569.
2. A. T. Brunger, Free R value: a novel statistical quantity for assessing the accuracy of crystal structures, in Nature, vol. 355, n. 6359, gennaio 1992, pp. 472–475, Bibcode:1992Natur.355..472B, DOI:10.1038/355472a0, PMID 18481394.

Voci correlate

• Fattore di struttura
• Funzione di Patterson

Collegamenti esterni

• Raffinamento cristallografico e validazione (PDF) ^[collegamento interrotto], su users.unimi.it.
• Corso di cristallografia — Cristallografia strutturale, su sites.google.com. URL consultato il 23 giugno 2014 (archiviato dall'url originale il 28 maggio 2016).