Ha militato nel Pumas fino al suo trasferimento nel Club América, nel 1969. Qui Borja è stato capocannoniere del campionato messicano per tre volte consecutive: 1970-1971 (24 goal), in 1971-1972 (26 goal) and in 1972-1973 (20 goal), vincendo il titolo nel 1971 e nel 1976.
Nazionale
Ha giocato 65 partite e segnato 31 goal con la maglia della Nazionale messicana. È stato convocato per due mondiali: 1966 (1 goal) e 1970.